添付されていたBlendファイルを使用してUV展開してみましたが正常に?展開されています。
展開した時の画像を添付しておきます。
現在のBlenderの最新バージョンは2.59.4です。
確認した環境は
Blender 2.59.4 Rev.40678
Windows XP 32bit
搭載メモリ 2GB
GPU Nvidia GeForce 9600GT

使用されているBlenderのバージョン、Rev、OSによってはUV展開に関する不具合を抱えていたのかもしれません。

BufTrackerを遡って確認されればそのような記載が見つかるかもしれません。
また、使用されているマシンリソース環境によるものかもしれません・・

もし処理中にエラーが発生しているのだとしたらコンソール画面に何か出力されているかもしれません。
確認されるといいかもしれません。