カメラをあるレイヤーに新たに一つ多く増やし、それをemptyオブジェクトとparentしtrack toしてそのレイヤーのオブジェクトをみるように操作したのですが、レンダリングの際に反映されません。
他のものが映るわけでもなく、なにもない状態になります。

なぜなのでしょうか？

情報が少なすぎるので以下から照らし合わせてください。
１）カメラがカレントカメラになっていない
２）Outlinerのレンダリングフラグがオフになっている（リストの右端にあるカメラアイコン）
３）レイヤがONになっていない

）カメラがカレントカメラになっていない
２）Outlinerのレンダリングフラグがオフになっている（リストの右端にあるカメラアイコン）
３）レイヤがONになっていない

以上の条件はすべてクリアしています。

ただカメラのアングル合わせの際（０押しのカメラ目線のアングル）にカメラのガイドラインが反応してくれず、オブジェクト自体をカメラの視界に持っていかなければならない状態です。

とても不便ですので、カメラのアングルを直接動かすことができればと思います。

引用：Track Toコンストレインの設定パネルにある「Align:Target」トグルスイッチを有効にすれば、Empty側の回転に従うようになりますよ。……ということかしらん。。万一おいらが質問読み違えてたらす申し訳ないです。

こちらでは2.49b、2.56aベータ共に別レイヤの追加カメラ＋Track Toコンストレインで問題なくレンダリングできています。環境はMac OSX 10.6/Mac mini Early2009モデルです。

>Track Toコンストレインの設定パネルにある「Align:Target」トグルスイッチを有効にすれば、Empty側の回転に従うようになりますよ。

操作しましたところ、確かにきちんとそれぞれが連動しているように思えます。
しかしやはりレンダリングになると全く反映されていないです。

私が思うにレイヤは１０くらいのところにカメラを追加してレイヤもONしています。
が、レンダリングの視界がどうもレイヤ１のカメラ（最初から設定されているもの）でレイヤがOFF状態（実際レイヤはOFFです）のようなのです。

Editting（F9）のLimk and MaterialタブのCA：のところは（ここがカレントカメラの指定の部分だと思うのですが）きちんとレイヤ１０のカメラになっているのです。

症状からしてどうも、レンダリングのカメラの指定が良くないのではないかと思います。

いかがでしょうか？

引用：それはそのカメラのデータの名前なので違います。
カレントカメラの指定は、[Ctrl]＋テンキー[0]でされていますか？
というか、そもそもEmptyを動かしてカメラの方向を指定されていますか？

あと、3Dビュー上とレンダリング上のスクリーンショットは上げられないですか？

複数のカメラの切り替えについて

以前このサイトで紹介されていた方法です。

この画像の赤い線のところを確認してください。
設定手順
1.画面上部のuse the scene's active camera and layers in this view. rather than local layers ボタンを押下します。
　これがONになっていないとカメラが切り替わりません。
2.Timeline画面でカメラを切り替えるポイントのところにマーカーを追加します。
　Timeline画面でMキーを押してカメラを切り替えるフレームのところにマーカーを追加。
3.Timeline画面で追加したマーカーにアクティブにしたいカメラを割り付けます。
　使用するカメラを選択して、CTRL+NUMPAD 0を押下します。
　カメラがアクティブになるとカメラオブジェクトの上部の三角形の部分の色が暗く変化するので分かります。
　カメラがアクティブになった状態で、Timeline画面の割り付けるマーカーを右クリックして選択します。
　この状態でTimeline画面でCTRL+Bを押下するとマーカーとカメラが結び付けられます。
4.3の操作をカメラの切り替え箇所全てに行います。
5.確認のためにTimeline画面でカレントフレームを右クリックドラッグして動かすとアクティブなカメラが切り替わるのがわかると思います。
　カメラの上部の三角形の色が変化して移っていればOKです。
6.NUMPAD 0を押下してカメラアングルにして、ALT+Aでアニメートしてみましょう。
:download:changeCam.blend

あれ?
画像が見えないので、こちらに添付します。

ctrl+0で切り替えることができました。

どうもありがとうございました！！