Cloth と Fluid はIpoではなく、独自形式のデータとしてtmpディレクトリなどの作業用のディレクトリにキャッシュを出力しています。そちらを解析すればどうにかなるかもしれませんが、バイナリ形式なのでソースを見ないと厳しいかもしれません。

もしくはモディファイア扱いであることを利用し、毎フレーム Mesh データを取得して頂点データとして出力するか。試してないのでできるかどうかはわかりませんが。

> FBXのExportが出来ないようですが
どうできないのか、エラーメッセージがどうなっているか、などの情報がないとなんとも。
Please install full version of pythonというダイアログが出ているなら、2.6.2フルバージョンをインストールして下さい。