yamyamさん、皆さんこんにちは。
先の件についてご報告しておこうと思います。

当方デスクとノートの2台のPCを使用しているのですが、コピー反転したBoneとJoin(統合)すると非アクティブBone（パープル色)が消えてしまうのはデスクのPCのみで起こるようです。

回答して頂いた内容はいつもノートで出先で確認していたので気づかず、家ではデスクを使用していてBlenderが問題なく使用できていると思っていたのですがどうもPCの問題の様なのです。

WBSさんのチュートリアルも参考に取り入れ手順どうりやっても統合して〜の所で駄目でした。昨夜ノートでJoinの所だけやってみると違いに気づいたのでデスクのBlenderを再インストールしましたがJoinだけ駄目でした。今のところ具合が悪い症状は他になく先日記載した手順（Joinをせず)でやると問題ないようです。左右どちらのBoneを選択しても両方選択状態になるので統合も出来ているようです。（Sample参照)

DESK TOP
CPU) Pentium4 1.5G
Memory) 128M
Video) Matrox G450 32M
OS) Windows 2000

NOTE
CPU) Celeron 1.8G
Memory) 256M
Video) Ati Radeon IGP340M (設定で32M)
OS) Window XP

とりあえず動いたので使っていましたが、やはりメモリとビデオのせいでこういった症状が出るのでしょうか。