http://blender.jp/modules/xfsection/article.php?page=1&articleid=165
http://blender.jp/modules/newbb/viewtopic.php?forum=3&topic_id=729
ちょうど↑の2つを併用する形です。

ArmatureObjcetをリンクします。
これはProxyObjectにしてモーションを追加したりします。
それ以外の雑多なMeshObject系はGroupにしてリンクします。
Outliner上では1個のEmptyObjectで表示されてます。
しかしParentの情報が消えています。

Objectだけを複数選択してリンクすればParent情報は残りますが
Proxy化したとたん
outliner上で階層構造がなくなってます。
Object数が多いのでわずらわしいです、階層構造にまとめたいです。

やり方が間違ってるのか　そもそもできないのか
知っている方いましたらアドバイスお願いします。

Blender2.55
Win VistaHomeBasic 32bit

Armatureオブジェクトも一緒にGroupに入れてください。
一応手順を記しておきます。

１）Armatureオブジェクトと形状オブジェクトをGroup化し保存。
２）参照を行いたいファイルから、Linkして１）のGroupをリンクする。
３）Emptyが選択されているので、そのまま[Ctrl]＋[Alt]＋[P]でメニューが表示される。
４）Armature オブジェクトの名前を入力・選択して[Enter]。
５）Armatureオブジェクト名_proxyと書かれたオブジェクトが Outliner に追加される。

この時点で Outlinerにはそちらの例というと、Empty、Armature_Knight_proxy、そして Armature と親子関係にないMesh オブジェクト（ターゲット用のMeshオブジェクトなど）が存在しているはずです。

ありがとうございます、できました！

これでムービー作業が大幅に楽になります！