Scale に-1をかけて行う反転では、Normalもすべて反転してしまうためです。特に害はありません。

ただ、[Alt]＋[D]によるコピーと、-1サイズ反転で行うこの方法は旧来の方法で、現在は、Mirrorモディファイアによって行うのが主流です。
わざわざコピーを作らずにすみ、継ぎ目も自動的にマージ（融合）してくれて便利なので、こちらをお勧めします。

適用するには、この状態からなら、現在[Alt]＋[D]によって追加されているコピーを消します。
次に、EditButtons([F9])の右側にあるModifierパネルの[Add Modifier]ボタンを押し、Mirrorを選択して下さい。

・[Merge limit]で、反転する軸の真ん中でマージする範囲を設定できます。

・作業が終わって、Bone をつけたりParticleを使用する場合、[Apply]ボタンを押すと実体化できます。
　再びミラー反転したい場合は継ぎ目部分から向こうの Vertex を削除後、Mirrorモディファイアを追加して下さい。

・必要があれば、SubSurfモディファイアを追加すれば、少ない面で細かな曲面を得ることができます。
　Mirrorモディファイア同様、Modifierパネルで追加して下さい。
　ただし、この場合、SubSurf モディファイアをMirrorモディファイアの下に移動することをお勧めします。
（パネル上の[Apply]ボタンの上にある[∧][∨]ボタンで移動）