動かす前に環境変数でPATHを通してください。

通常の解凍では次のようになります（XPの場合,新規に設けるケースです。すでにPATH項目が設定してある場合は、下記の追加訂正及びyamyamさんのコメント記事を参照ください）
環境変数名　PATH
環境変数値　C:\ply2mqo2
でオーケーです。

（追加訂正：すでにある場合は環境変数値の最後に
”；”を追加すること。具体的には；C:\ply2mqo2とします。）

あとは、コマンドプロンプトを起動させ、以下の順にコマンドを打ちます。実行ファイルがC:\ply2mqo2にある前提での説明です。
C:と入力、エンターキーを押す
cd \ply2mqo2と入力、エンターキーを押す
ply2mqo plyfile.plyと入力、エンターキーを押す（plyfileには、変換したいplyファイル名を入れる）
これで、キー入力に間違いがなければply2mqo2内に変換されたmqoファイルが生成されます。
現時点で、変換確認できたplyファイルは
bunny、hippo、elephant、Horse、lucyの5点。
作者のBee氏によると、データに頂点カラーが含まれるものは変換できないそうですので、注意してください。またPCのスペックにより変換できても、メタセコの方で落ちる場合もありますので、使用については自己責任でお願いします。
ちなみにBee氏は、Parthenon Renderer というGIレンダラーの作者でもあります。
データについては、作者の方のページからの引用ですが、
以下のページが役に立ちます。
http://www.cs.princeton.edu/gfx/proj/sugcon/models/
ちょっと古いですが、以前にQuick３Dという別の変換ソフトを使って
Blenderでレンダリングした画像をアップしてみました。


このソフトは、期間限定の上、、総合変換ソフトなので、ply2mqoに比べて、容量などの点で大掛かりになってしまいました。この点でこの
ply2mqoは軽量級なのがありがたいです。