Blender2.49b時代のYafray(当時はこの名前だったのかな?)も試して見ましたが
通番形式のファイルしか吐き出さないみたいですが・・・・
元々Movie形式で出力していたものなのですか?

2.49b時代のものは出力形式でAVI形式は指定できても結果は通番ファイルしか出してないみたいなので・・・

yafarayの出力画像自体、映像にすると意味がなくなるように思いますが・・・・
yafarayの出力は静止画でこそ意味があるんではないですか?

個人的には映像として使用するのであれば、yafarayにこだわる必要性がないと思います・・・・
(映像は静止画と違って１コマ１コマに要求される緻密さが非常に低いから・・・・)