yamyamさん、お返事ありがとうございます！

おっしゃる通りにオブジェクト同士の距離を遠ざけたり、重なったポリゴンがないかを
調べたりしたのですが、問題は解決しませんでした
　ふと、オブジェクトに使ってないテクスチャがあるのかなと思いそれらも消したのですが変わらず、
UVが複数個ついてたりしないかも見てみたのですが、問題が解消せず。。

…諦めかけた矢先、さきほどようやく原因をつきとめる事ができました

オブジェクトをミラーモディファイヤで作成している状態でのベイクなので、ぶれんだー側の計算がおかしくなったのかもしれませんが、
ライトの当て方がX軸に対して完璧に垂直な状態でないと、魚の鱗状態が出るようです。（画像添付しておきます）

ライトをまっすぐ当てるようにしたらちゃんと綺麗にベイクされました

ミラーモディファイヤで作る最中のベイク時は、ライトの当て方も注意しないといけないのかもしれませんね。