自己レスです。
3ds形式でexportし、新規ファイルにimportしてみました。
結果としてテクスチャー情報が欠けてしまいましたが、形状はうまく取り込めているようです。
この状態でcubeを追加してみると、辺の長さが0にならず問題なく追加できました。
気になることとしては、importしたデータの周辺を見てみると、原点からかなり離れたところにオブジェクトがありました。座標が大きな値になっていたときにそのまま作成した物体が残っていたのかもしれません。
今回のファイルでテクスチャーを貼りなおすか、他の方法で対応できないかもう少し考えてみようと思っています。
テクスチャの件を含め何かアドバイスなどありましたら、教えていただけると幸いです。