2.49ではrenderボタンの所にプルダウンメニューが無くなって使えませんね。
ということで、反則技かも知れませんが、
http://www.zoo-logique.org/3D.Blender/index.php3?zoo=com
から、win32blend2pov090530.zipという（SVN Révision20515, compilee avec VC++ 、 30/5/2009 09:39:25）POV RAYのレンダリングメニューの追加された（Windows用）フォーク版をダウンロードしてきて、解凍した実行ファイル「win32blend2pov090530.exe」をさきの2.49をインストールしたフォルダのBlender.exeのある場所に移動して貼り付けます。
それを実行するとPOVのレンダリング設定メニューのほかYAFRAYメニューも使えるようです。
当方の環境では無事YAFRAYが起動してレンダリング出来ました。
ただ、当方簡単な確認のみで深く検証していません。コレによる不具合等にについては自己責任でお願いします。