とりあえず時間の都合で検証は今は全くできないのですが、スクリプト自体がバージョンアップしてたらそれを使ってみたり、Blender RC2でテストしてみたりして下さい(単にBlender RC2を展開し、.blender/Scriptsフォルダにスクリプトを入れるなどするだけでOKだと思います)。

あと、引用：だけだとあまりにも漠然としすぎて誰も答えられないと思います。できるだけ再現できる手順を書かれた方が原因が究明しやすいでしょう。

最後に残念ですが、WindowsME や、その他9x系 Windows は、Blender だけでなく、他のほとんどのソフトでも、安定動作は期待できないことを理解しておいて下さい。現に多くのソフトではすでに動作保証外のOSです。
知識を増やせば安定度は増しますが、実際障害が発生しても、OSが悪い、としか返答されないでしょう。